Optymalizacja obiegu pracy w międzynarodowym projekcie kodów kreskowych DNA

Optymalizacja obiegu pracy w międzynarodowym projekcie kodów kreskowych DNA

Kanadyjski ośrodek kodów kreskowych DNA (CCDB), znajdujący się na Uniwersytecie Helf University w Toronto, jest integralną częścią międzynarodowego projektu kodowania barowego dla Living Beings. Projekt tworzy referencyjną bazę danych kodów kreskowych krótkich znormalizowanych regionów genów. Celem projektu jest zidentyfikowanie i ustalenie pięciu milionów próbek ponad 500 000 gatunków w ciągu 5 lat.

Od 2009 roku Centrum przetwarza rocznie około 300 tysięcy próbek DNA pochodzenia zwierzęcego, roślinnego i grzybowego. Próbki wchodzące do CCDB przechodzą standardowe procedury genomowe z ekstrakcją DNA i amplifikacją PCR. Zastosowane metody analityczne obejmują ponadto sekwencjonowanie kodu kreskowego DNA dla zwierząt, które wynosi około 650 par zasad genu COX. W przypadku roślin stosuje się geny chloroplastów rbcL i matK.

Proponowane rozwiązanie likwidatora96